青色申告の記帳について質問です。

Webデザイナーをしてまして、とある企業からデザインの仕事を請け負っています。月末締め、翌月末振込みという形です。

今年の3月分の作業は突如として3月末に振り込まれました。
そこまでは問題なかったのですが、
3月分の報酬が先月末にも振り込まれてしまったのです。

会社側に伝えて返事を待っている状態ですが、
こういった場合、記帳はどうしたらいいのでしょうか？
やよいオンラインを使っているのですが何せ今年から始めたばかりで
慣れていないのでこういった突然の事に対応できません・・・。

今のところ思いつくのは着手金扱いにしてもらいこちらで請求書を書き直す、
くらいしか思いつかないのですが・・。

フリーって大変ですよねえ。
こんなに企業がテキトーなことやってばかりいるなんて
フリーになるまで知りませんでした。